Originaire d’Angers, il a effectué une partie de sa carrière dans l’administration pénitentiaire, avant d’occuper les fonctions de directeur de cabinet du préfet de Vendée puis directeur de cabinet du préfet du Finistère. Sébastien Cauwel remplace Cécile Lenglet, qui était arrivée en Aveyron en mai 2012.